구차니의 잡동사니 모음

shift-f4 는 아니고

shift-ctrl-y로 '반복' 이라는 이름으로 마지막 행동을 반복하는 설정이 있다.

그래도F4가 아니니 좀 많이 불편하구만..

[링크 : https://forum.openoffice.org/en/forum/viewtopic.php?f=9&t=96740]

[링크 : https://forum.openoffice.org/en/forum/viewtopic.php?f=9&t=6258]

정상작동 되는지 전체가 들어간지는 아직 몰라서 확인이 필요함.

예전에 3 letter를 1letter로 replace를 이용한 건 편리했는데

1letter를 3letter로 바꾸는건 오류가 있어서 못쓰다가, 이번에 반복문을 이용해서 한번 시도해 봄

DO $$ 
DECLARE
   hgvspthreeletter text := 'Thr790Met';
   hgvsponeletter text := 'T790Mfs';
   hgvslen integer := length(hgvsponeletter);
   i	integer := 1;
   result	text;
   conv		text;
   res		text;
BEGIN 

--    RAISE NOTICE '%의 길이는 %이며 원래는 % 임', 
--        hgvsponeletter, hgvslen, hgvspthreeletter;

while i<= hgvslen loop
	select substring(hgvsponeletter, i, 1) into result;
	 SELECT i+1 INTO i;
	SELECT case 
		when result = 'A' then 'Ala'
		when result = 'B' then 'Asx'
		when result = 'C' then 'Cys'
		when result = 'D' then 'Asp'
		when result = 'E' then 'Glu'
		when result = 'F' then 'Phe'
		when result = 'G' then 'Gly'
		when result = 'H' then 'His'
		when result = 'I' then 'Ile'
		when result = 'J' then 'Xle'
		when result = 'K' then 'Lys'
		when result = 'L' then 'Leu'
		when result = 'M' then 'Met'
		when result = 'N' then 'Asn'
		when result = 'O' then 'Pyl'
		when result = 'P' then 'Pro'
		when result = 'Q' then 'Gln'
		when result = 'R' then 'Arg'
		when result = 'S' then 'Ser'
		when result = 'T' then 'Thr'
		when result = 'U' then 'Sec'
		when result = 'V' then 'Val'
		when result = 'W' then 'Trp'
		when result = 'X' then 'X'
		when result = 'Y' then 'Tyr'
		when result = 'Z' then 'Glx'
		when result = '*' then 'Ter' -- '*'
		else result
	end INTO conv;
	SELECT concat(res, conv) into res;
-- 	raise notice '% %' ,conv,res;
	end loop;
	
	raise notice '%' ,res;
END $$;

[링크 : https://www.hgvs.org/mutnomen/codon.html]

[링크 : http://www.gisdeveloper.co.kr/?p=4621]

[링크 : http://www.gisdeveloper.co.kr/?p=4573]

[링크 : https://w3resource.com/PostgreSQL/substring-function.php]

디버깅 방법은 좀 찾아 봐야겠지만..

일단 텍스트에 대해서 length로 반복 횟수를 정하고

substr()로 특정 위치의 값 하나를 빼내서

다른 변수에 치환해서 넣어주면 원하는 기능을 구현을 할 수 는 있을 것으로 보인다.

[링크 : http://www.gisdeveloper.co.kr/?p=4573] <<

[링크 : http://www.gisdeveloper.co.kr/?p=4621]

[링크 : http://www.postgresqltutorial.com/plpgsql-loop-statements/]

배열내의 내용을 검색하는 거라고 들었지만

실제로 내용을 보면 그런 용도와는 좀 다른 느낌.

[링크 : https://www.w3schools.com/sql/sql_any_all.asp]

[링크 : https://stackoverflow.com/questions/34627026/in-vs-any-operator-in-postgresql]

오류: "array_agg" 칼럼을 하나 이상 지정했음

에러만 봐서는.. array_agg 컬럼을 여러개 써서 그런거 같은데

(한 쿼리에 array_agg를 여러번 쓰면 안되는 것으로 이해함)

정작 에러코드를 찾아가보면 컬럼명이 동일한게 존재하기 때문에 발생하는 에러라고 해석된다.

array_agg라는 이름으로 컬럼명이 생성되다 보니 그런건데.. 해석이 아무리봐도 이상한 듯..

결론은.. as로 다른 이름을 지정해주면 끝.

[링크 : http://www.sqlerror.de/db2_sql_error_-121_sqlstate_42701.html]

좀 봐야 할듯..

join으로 테이블들 큰 것 합치다 보면 오래 걸리는데 그것에 대한 설명.

[링크 : https://baseofmint.tistory.com/5]

[링크 : https://jojoldu.tistory.com/162]

grep으로 확인했었는데 vi에서도

/ 대신 : 명령을 통해 몇번이 매칭되는지 확인이 가능하다.

"로 끝나는 줄을 검색하기 위해서는 아래의 명령을 하면되는데

/"$

총 몇줄이 매칭되는지 보려면 아래와 같이 :로 시작해서 하면된다.

:%s/"$//n

[링크 : https://recordar.tistory.com/entry/vi-문자열-검색-갯수]

말이 어렵다 -ㅁ-

array_agg()를 통해서 합치게 되면

{1,2,3} 이런식으로 중괄호가 붙게 되는데

이걸 없애고 순수하게(?)

1,2,3 으로만 출력하게 하는 방법

아래와 같이 하면 array_agg에 의해 배열로 {}로 붙게 되고 array_to_string()에 의해

{}가 제거된 채 원하는 의도대로 1,2,3 으로 출력되게 된다.

[링크 : https://stackoverflow.com/questions/11899024/postgresql-query-to-return-results-as-a-comma-separated-list]

사이트들 뒤지다가 나온 SQL문 공부하는데 사용하기 용이한 샘플 데이터베이스

SQLite용으로 보이지만.. 일단 테이블도 꽤 많고 공부하기에는 부족함이 없을 듯하다.

[링크 : https://www.sqlitetutorial.net/sqlite-sample-database/]

create view는 먼가.. 막 복잡할줄 알았는데 별 차이가 없네?

query 부분을 ' '로 감싸면서 안에 있는 '를 막 '''로 치환해줘야 할 줄 알았는데..

[링크 : https://www.postgresql.org/docs/9.2/sql-createview.html]

[링크 : https://blog.naver.com/jdub7138/220863929987]

materialzied view 라는게 pgadmin에서 본게 기억나서 찾아보니

단순하게 메모리에 생겨나는게 아닌 물리적으로 공간을 차지하는 뷰라고 한다.

오라클에서 처음 도입되었다고 하는데. 그건 나에게 중요한건 아니니..

[링크 :https://ko.wikipedia.org/wiki/구체화_뷰]

[링크 : http://www.gurubee.net/lecture/1857]

postgres 9.3 이후버전 부터 사용이 가능한 것 같고

(다만 9.3 버전은 unsupportted 버전으로 지정되었지만.. 여기서 unsupportted는 LTS등의 기간이 끝난거겠지?)

view랑은 아무튼 구분되어서 저장되는 것으로 보인다.

[링크 : https://www.postgresql.org/docs/9.3/rules-materializedviews.html]